时隔一年，美国医学遗传学和基因组学学会（ACMG）在《GENETICS IN MEDICINE》上再次发布了临床外显子组和基因组测序（ES/GS）次要发现（secondary findings, SF）报告的政策声明，给出了最新的共包含78个基因的ACMG SF v3.1列表（见表1），主要增加了v3.0更新时由于外显率有限等原因未被纳入列表的5个基因。

本次更新增加了5个基因，其中TNNC1、RBM20、BAG3和DES主要与扩张型心肌病（DCM）相关，TTR基因主要与转甲状腺素蛋白淀粉样变性（ATTR）相关。对于TNNC1、RBM20、BAG3和DES基因，之前在v3.0更新时未被纳入候选增补基因但很可能符合纳入标准，在本次更新时，由于未经治疗的DCM表型的严重性以及基于这些基因的致病/可能致病（P/LP）变异的干预具有强大潜在效益，最终被ACMG次要发现工作组（SFWG）添加到SFv3.1列表中。TTR基因之前在v3.0更新时就已经被SFWG纳入候选增补基因，但最终没有包括在SFv3.0列表中。直至最近人口流行率的新数据证实了其高度外显率以及美国食品和药物管理局（FDA）批准了ATTR-CM治疗方法，这一基因被重新考虑并添加到SF v3.1列表中。

表1. ACMG SF v3.1基因及相关疾病列表

注：AD，常染色体显性遗传；AR，常染色体隐性遗传；XL，X连锁遗传。其中红色下划线的基因为新增的5个基因。

除了新增5个基因外，SFWG在本次更新时，考虑过3个与癌症风险或血液学相关的基因：RAD51C、RAD51D和RUNX1（见表2），但由于外显率有限、胚系遗传性质未被确定以及非灾难性的临床表现等原因最终未被纳入ACMG SF v3.1列表。

表2. SF v3.1列表中未纳入的基因

最近发表的两项基于人群的大型病例对照研究中，携带RAD51C/D致病性变异（特别是截短变异）的女性患乳腺癌的风险高达30%，并与ER阴性和三阴性乳腺癌相关的风险也会增加。但是，缺乏RAD51C/D与卵巢癌的研究，并且关于将其他中等外显率乳腺癌基因（例如ATM和CHEK2）纳入SF列表的讨论正在进行中，SFWG这次并没有将RAD51C/D纳入ACMG SF v3.1列表中。而SFWG决定ACMG SF v3.1列表中不包括RUNX1基因，出于多种原因：（1）与大多数基因一样，来自基因组确定（相对于家系或临床）队列的外显率和流行率数据有限；（2）需要确认RUNX1变异的胚系性质；（3）非灾难性临床表现。此外，尽管髓系恶性肿瘤的风险升高，仍缺乏降低这种风险的循证指南。

SFWG将SF报告的政策和原则的更新与SF基因列表的更新分开，预计总体政策只会在需要时更新，可能每隔几年更新一次；而SF基因列表的更新将每年进行一次，并且每年大约在同一时间发布，以便实验室和报告流程的修改。