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NEJM:NGS可用于AML患者的MRD检测和复发预测
发布时间:2020-01-15 20:00:00来源:

引言

急性髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML)是一个高度异质性的疾病,对治疗有不同的反应。虽然大多数新诊断的AML患者在接受强化治疗后形态学完全缓解,但复发率仍然很高。下一代测序(Next-generation sequencing,NGS)技术几乎在每个患者身上都能检出微小残留病变(minimal residual disease,MRD),但其在预测复发方面的临床价值尚未确定。一项发表在NEJM的研究显示,在AML患者完全缓解(complete remission, CR)期间基于靶向测序的MRD检测与患者的复发和死亡风险增高相关。该研究纳入482名18~65岁新诊断的AML患者,在初诊时和CR期进行NGS基因突变组合检测(54基因),探讨NGS检测在AML患者MRD检测和复发预测方面的临床应用价值。



初诊时和完全缓解期间的AML基因突变分析

01


NGS检测结果显示,新诊断的482例患者中,430例(89.2%)至少携带一种突变,每个人平均携带2.9个突变,最常见的突变为NPM1、DNMT3A、FLT3和NRAS(图1A)。430例患者初诊和CR期的2次NGS检测结果显示,51.4%的患者在CR期突变持续存在,且突变等位基因频率存在很大的差异(0.02%~47%,图1B)。DTA(DNMT3A、TET2、ASXL1)突变最常见,频率通常高于2.5%,与白血病幼稚细胞的比例不一致(<5%);反之,IDH1、IDH2、STAG2、TP53和其他基因突变偶有突变频率高于2.5%的持续存在,这些基因突变频率的改变与形态学CR状态基本一致。DTA突变通常与年龄相关的克隆性造血相关,持续的DTA突变可能代表了非白血病克隆。在初诊时同时存在DTA和非DTA突变的133例患者中,CR期非DTA突变一般被清除,但其中90例患者(67.7%)在CR期通常仍可检测到DTA突变,该结果与CR期带有DTA突变的残余细胞代表非白血病克隆而非持续性恶性疾病的观点一致。


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图1初诊和CR期的基因突变(A)以及CR期的突变等位基因频率(B)



非DTA突变是AML患者预后评估的独立指标

02



持续的DTA突变与4年的复发率没有显著的相关性。然而,在CR期持续存在DTA突变的患者中,同时持续存在非DTA突变对AML复发具有较高的预测价值(4年复发率,检测到的为66.7%,未检测到的 39.4%;P = 0.002),是预后评估的独立指标(图2A)。随后,研究者评估了持续存在的非DTA突变与复发风险的关系,发现任何等位基因频率的非DTA突变的持续存在都与AML的复发风险增加密切相关(4年复发率,检测到的为55.7%,未检测到的为34.6%;P=0.001),无复发生存率(4年无复发生存率56.7%,无复发生存率36.6%;P=0.006)和总生存率降低(4年总生存率,检测到的65.3%,未检测到43.7%;P=0.001)密切相关(图2B)。


为了评估结果的可重复性,研究者对另一队列进行非DNA突变与复发率、无复发生存率和总生存率关系的验证,二者的结果一致(图2B,2C)。在试验组和验证组的430名患者中,28.4%的患者在CR期检测到持续存在的非DTA突变。


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图2 持续存在DTA突变患者的复发率(A),所有患者的复发率(B)和总生存率(C)




NGS联合流式细胞术用于AML患者的MRD监测

03


目前,流式细胞术在CR期AML患者复发预测方面的应用日益增多。研究者通过对340例患者进行NGS和流式细胞检测,比较NGS非DTA突变和流式MRD阳性的一致性。结果显示,69.1%的患者的检测结果一致(30例检测到残留,205例未检测到残留),而64例患者仅NGS检测到持续性非DTA突变,41例患者仅在流式细胞术中检测到MRD阳性。在两种方法检测均为阳性的患者中,4年复发率为73.3%;仅测序的阳性患者中,4年复发率为52.3%;仅流式检测阳性的患者中,4年复发率为49.8%。两种方法检测均阴性的患者中,4年复发率为26.7%(图3)。因此,联合使用NGS和流式细胞术进行MRD监测,对于AML患者的疾病复发、无复发生存和总生存率具有独立的预后价值。


图3 NGS和流式细胞术用于MRD监测的复发预测效能



小结

针对482例AML患者(初诊与CR期)的靶向NGS检测结果显示,89.2%的患者至少携带一个基因突变,51.4%初诊突变阳性的患者在CR期突变持续存在,其中DTA突变(DNMT3A、TET2和ASXL1基因)等位基因频率较高,DTA突变常与年龄相关的克隆性造血相关,但CR期的DTA突变与4年复发率增加无关。因此,DTA突变不是AML患者合适的MRD监测指标,而非DTA突变的持续存在是AML患者复发和生存的独立预后不良因素。NGS与流式细胞检测联合用于AML患者的MRD检测有更显著的预后预测价值。


参考文献:

Jongen-Lavrencic M, Grob T, Hanekamp D, et al. Molecular minimal residual disease in acute myeloid leukemia[J]. New England Journal of Medicine, 2018, 378(13): 1189-1199.



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