首页
产品服务
心血管疾病系列肾病系列肿瘤系列心血管用药系列肾病用药系列二代测序商业试剂盒
科研合作
新闻中心
关于我们
不同检测方法应对新冠肺炎疫情
发布时间:2020-02-18 18:00:45来源:
 冠
 肺
 炎

2020年2月12日0时-24时,湖北新增新冠肺炎病例14840例,较前几日大幅增加,引发民众大量讨论。这一日新增病例数字之所以如此惊人,是因为湖北省将临床诊断病例数纳入确诊病例数进行公布。那么,有人要问了:是不是核酸检测不能成为诊断新冠肺炎的依据呢?根据《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版)》,在湖北省的病例诊断分类中虽然增加了“临床诊断”,但是确诊病例诊断标准并没有变:

1. 需有呼吸道标本或血液标本行实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性;

2. 或病毒基因测序,与已知的新型冠状病毒高度同源。

由此可见,病毒核酸检测仍是确诊感染的“金标准”

021801.jpg

其实,自1月10日武汉新型冠状病毒基因组序列被首次破译并对外公布以来,国内众多科学工作者及IVD厂商迅速组织开展新型冠状病毒检测试剂的研发工作,检测试剂盒研制成功的好消息不断从全国各地传出,检测所需时间也一再缩短,为诊断新冠病毒肺炎提供了有力的支持。这些检测试剂盒运用的检测方法不尽相同,主要包含以下几种:荧光定量PCR(qRT-PCR)、片段分析、高通量测序(NGS)以及特异抗体检测等。为全面了解这几种检测方法在新冠病毒诊断不同方面的应用,本文对这几种检测方法做简要介绍:

021802.png



 荧 光 定 量 PCR

以2019-nCoV新型冠状病毒的高度特异性序列为靶区域,设计特异性引物和荧光探针,通过多重荧光PCR扩增,实现对2019-nCoV新型冠状病毒RNA的检测。这种方法也是目前新冠病毒检测试剂盒中最常用的检测方法。灵敏度及特异性都很高,检测时间在2h左右。同时,这种方法对样本采集以及检测实验室规范要求很高。若样本采集不到位,标本所带病毒量较少;实验操作失误,造成病毒RNA降解,易造成检测出现“假阴性”。为解决此问题,可在试剂盒中加入内源性内参的引物探针,用内源性内参的结果来质控标本采集提取及实验操作流程是否无误。


021803.png



片 段 分 析

以2019-nCoV新型冠状病毒的高度特异性序列为靶区域,设计特异性逆转录引物及扩增引物,进行普通PCR扩增,PCR产物采用Sanger测序仪的片段分析功能进行检测,根据在目标片段长度位置是否出现检测峰为依据进行结果判断。此方法可根据不同待检病毒靶标设计不同目标长度的产物,进行多靶标检测,进而区分患者感染的是哪种冠状病毒,做到冠状病毒的分型检测。


高 通 量 测 序

高通量测序技术通过对待测目标的文库构建,测序,序列拼接比对获得待测目标基因组序列的全貌。对在此次武汉疫情爆发初期,通过构建宏基因组文库进行NGS测序鉴定出新型冠状病毒,并成功绘制出其全基因组序列信息。迅速判断出此次爆发的冠状病毒为一种新的冠状病毒,与SARS病毒序列高度相似。正是有了新冠病毒全基因组信息,才能使国内科学家及诊断企业研发荧光定量试剂盒用于新冠病毒的检测。目前,到了疫情攻坚战的此刻,新冠病毒溯源、流行、变异规律、变异监测、分子流行病学、人类感染的发病机理等尚待进一步明确。


这时,NGS技术在解析病毒变异情况和追踪病毒起源及演化方面,扮演着不可替代的核心作用。


此次2019-nCoV病毒为RNA病毒,在传播过程存在发生变异的可能性,并在一定程度上将影响RT-PCR的敏感性,采用高通量测序方法则可解决这一问题,并监测到可能的病毒变异。部分病毒含量较低的样本,在低于RT-PCR最低检出限时,采用高通量测序方法则可以提高阳性检出率,避免漏检和错检;对于疑似感染、多重感染或继发感染病原,采用高通量测序方法则可进行并发检测,提供更多可能感染的病原信息。


总之,从测定未知病原,到鉴定已知序列,再到阳性样本的结果确认以及可能存在的序列变异动态监控,都可以采用NGS方法有效应对。但NGS方法对实验室及实验人员操作要求是这几个检测方法中最高的。


021804.png



特 异 抗 体 检 测

抗体是机体感染病毒后,体液免疫应答的产物。通常,免疫球蛋白M(IgM)抗体在感染早期出现,免疫球蛋白G(IgG)抗体在感染中晚期出现。通过血清学检测,利用抗原抗体的特异性结合原理,配合标记物显色筛查,实现对人体血清、血浆或全血中新型冠状病毒IgM/IgG抗体的体外定性检测。


简言之,检测特异抗体也可以明确患者是否“近期或既往感染过新型冠状病毒”,有助于核酸检测阴性但临床上疑似患者的确诊。其主要优点在于现场即时诊断,不要任何检测设备,具备快速、便捷、高效检测的特点,可用于社区基层医院甚至家庭的早期初步筛查。


另一方面,核酸检测多采用上呼吸道样本(咽拭子为主),采集过程对于医护人员暴露风险极大,而抗体检测是通过血液样本检测,感染风险降低。但抗体检测容易受到血液标本中的一些干扰物质(如非特异IgM、类风湿因子、溶血所致的高浓度度血红蛋白等)的存在而出现“假阳性”结果,所以抗体检测必须采用IgM 和IgG同时检测且通常需多次动态检测来确认。


因此,特异抗体检测阳性不能像病毒核酸检测阳性一样作为病毒感染的“金标准”


总    结

每种检测方法都有各自的优缺点,为防止错检、漏检,应综合考虑适用场所、人群及疑似患者病毒携带量等问题,必要时根据临床诊断进行选择。精准的qRT-PCR检测,配合必要的基因测序复核及抗体水平的评估是诊断新冠病毒最佳组合。


关于我们


推荐新闻

咨询服务热线

+86 10 5849 9280

© Copyright - 安智因 京ICP备18055458号-1