最近在《European Heart Journal》上发表了题为“Evaluation of gene validity for CPVT and short QT syndrome in sudden arrhythmic death”的文章,对此前报道的与CPVT和SQTS相关的主要基因进行再次分析评级。
背景介绍
儿茶酚胺敏感型室性心动过速(CPVT)和短QT综合征(SQTS)是可导致猝死的遗传性心律失常性疾病。据报道,许多基因可导致这两种疾病,但支持这些基因与疾病相关的证据差异很大。为了确保CPVT和SQTS患者的基因信息得到适当利用,作者对先前报道的基因重新进行了循证评估。
研究方法
三个不同团队均参考ClinGen Gene Curation Framework version 7,分别对11个与CPVT相关基因和9个与SQTS相关基因的所有已发表证据再次评估审核。最后,三个团队的汇总结果由一个离子通道病专家小组进行最终审核分类。
研究结果
11个与CPVT相关基因中,有7个基因与疾病的相关性证据为“明确”或“中等”,其中4个基因RYR2、CALM1、CALM2和CALM3为常染色体显性遗传,CALM1、CALM2和CALM3为CALM基因家族,编码相同的蛋白质(钙调节蛋白),这些基因中的任何变异都可能导致LQTS表型,有大量文献报道这些变异即会导致CPVT表型的单独出现,也会引起LQT和CPVT的混合表型(静息时QT延长和运动诱发的多态性室性心律失常);另外3个基因CASQ2、TRDN、TECRL为常染色体隐性遗传。此外,4个有争议的CPVT相关基因中有3个(KCNJ2、PKP2、SCN5A)被专家组认为并不能导致典型的CPVT临床表型,作者目前调查的panel中没有PKP2基因,最近的一份报告中,在1名已诊断为儿茶酚胺敏感型多态性室性心动过速的患者中发现了该基因的截短变异,故作者将PKP2纳入了重新评估的过程。最后1个基因(ANK2)在人群中太常见,可能不会导致该疾病。具体结果详见表1。
9个与SQTS相关基因中,有1个基因(KCNH2)被归类为明确基因,另外3个基因(KCNQ1、KCNJ2、SLC4A3)具有强或中等证据,在作者目前调查的检测panel中,并未发现SLC4A3基因,且专家组对该基因与SQTS疾病的相关性结论不一致;SLC22A5基因不会引起SQTS,但该基因导致的全身原发性肉碱缺乏症可能类似SQTS。SQTS基因的大部分遗传证据来自极少数变异(KCNJ2中有5个,KCNH2中有2个,KCNQ1/SLC4A3中有1个)具体结果详见表2。
表1:儿茶酚胺敏感型室性心动过速基因的证据分类
表2:短QT综合征的基因证据分类
结论
该研究参考ClinGen curation framework,全面重新的评估了与CPVT和SQTS相关的主要基因的证据。被确定为具有明确致病证据的基因应纳入这些疾病的临床基因检测panel,证据不足的基因或导致其他心律失常表型的基因在测序后应谨慎解释。这将使诊断性的基因检测方法更加循证,有助于减少不确定性或假阳性结果的数量。文章建议在患者治疗之前,应采用一种系统的、基于证据的方法来评估所有已报道的或新的基因-疾病关系的有效性,在调查这些疾病的遗传原因时,应注意遗传和表型数据,进而充分评估基因与疾病的相关性。
参考文献
Walsh R, Adler A, Amin AS, Abiusi E, Care M, Bikker H, Amenta S, Feilotter H, Nannenberg EA, Mazzarotto F, Trevisan V, Garcia J, Hershberger RE, Perez MV, Sturm AC, Ware JS, Zareba W, Novelli V, Wilde AAM, Gollob MH. Evaluation of gene validity for CPVT and short QT syndrome in sudden arrhythmic death. Eur Heart J. 2021 Sep 24:ehab687.